Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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