Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNW5

WDR6, WD repeat-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR6Q9NNW5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WDR6Q9NNW5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms