Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00597Q9H2U6 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms