Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP58Q9BVL2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms