Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CPNE2Q96FN4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CPNE2Q96FN4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CPNE2Q96FN4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CPNE2Q96FN4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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