Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
KRTAP20-2Q3LI61 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms