Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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SSPNQ14714 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SSPNQ14714 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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