Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SPOCK1Q08629 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms