Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CD164Q04900 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CD164Q04900 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CD164Q04900 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CD164Q04900 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CD164Q04900 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CD164Q04900 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms