Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CENPCQ03188 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CENPCQ03188 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms