Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms