Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
IRX1P78414 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IRX1P78414 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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