Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ALDH9A1P49189 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms