Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCM3P25205 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCM3P25205 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MCM3P25205 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCM3P25205 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCM3P25205 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MCM3P25205 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms