Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP2A2P16615 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms