Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPAG9O60271 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms