Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF1O43189 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PHF1O43189 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PHF1O43189 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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