Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LINC01387J3KSC0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01387J3KSC0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms