Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms