Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RGPD3A6NKT7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RGPD3A6NKT7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms