Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
HECTD4Q9Y4D8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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HECTD4Q9Y4D8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HECTD4Q9Y4D8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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