Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UTP11Q9Y3A2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms