Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGSF9Q9P2J2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGSF9Q9P2J2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms