Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF275Q9NSD4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms