Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPZA3Q96KX2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPZA3Q96KX2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms