Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTSSAQ969W0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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