Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms