Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CARTPTQ16568 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CARTPTQ16568 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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