Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHRNB3Q05901 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms