Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNTAP49354 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTAP49354 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms