Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TUBB4AP04350 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms