Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SNAPINO95295 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms