Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CCDC153-202ENST00000415318 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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