Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MCRIP1C9JLW8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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