Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GOLGA6BA6NDN3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GOLGA6BA6NDN3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms