Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZNRF3Q9ULT6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms