Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNFT2Q96EX2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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