Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RUNDC1Q96C34 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RUNDC1Q96C34 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms