Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYT9Q86SS6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms