Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

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Length 843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC27Q6P3X3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC27Q6P3X3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC27Q6P3X3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC27Q6P3X3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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TTC27Q6P3X3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TTC27Q6P3X3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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