Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms