Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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COL24A1Q17RW2 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COL24A1Q17RW2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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