Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RPE65Q16518 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RPE65Q16518 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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