Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PCLAFQ15004 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms