Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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NWD1Q149M9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NWD1Q149M9 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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