Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBX3Q13185 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBX3Q13185 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBX3Q13185 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CBX3Q13185 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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