Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXC1Q12948 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXC1Q12948 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXC1Q12948 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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FOXC1Q12948 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXC1Q12948 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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