Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDH17Q12864 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CDH17Q12864 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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