Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEFHP12036 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEFHP12036 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEFHP12036 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms