Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
VPREB1P12018 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms